Mon module est complètement indépendant du module Documents. Dans la définition de mon module, j'ai bel et bien défini mon nouveau business controller, il apparaîrait dans ses settings...
Controller class: DotNetNuke.Modules.Fichiers.FichierController, DotNetNuke.Modules.Fichiers
L'indexation semble se faire sans erreur... dans l'historique Succeeded est à true partout.
J'ai remarqué que dans la BD il y avait le champ SupportedFeatures qui était à 0 pour mon module. Je l'ai mis à 3 (Portable=1, Searchable=2,Upgradeable=4) et j'ai finalement mes 2 petits crochets dans les settings de mon module pour Portable et Searchable. Par contre, l'indexation ne semble pas se fier à ce champ car je n'ai remarqué aucun changement après une nouvelle indexation.
Je continue mes recherches!!!