Bien, puisque personne ne semble avoir la solution, voici ce que j'ai trouvé pour corriger le problème.
1ère constatation: la 5.1.4 ne corrige toujours pas le problème.
2ème constatation: le problème apparait avec la version 5.0.1
Ayant sous la main pas mal de versions, j'ai installé une 5.0.0 sur un autre port (10080). L'installation passe sans soucis et l'authentification dans le site fonctionne. Ensuite, j'ai installé un pack langue. Les choses se compliquent lorsque j'ai voulu créer les alias du site sur le port 10080. Il ne veut rien savoir. Le site ne fonctionne qu'en localhost:10080.
Un petit iisreset puis upgrade direct vers la 5.1.4. Tout passe bien et avec cette version, la création des alias fonctionne. Il ya donc un petit mieux de ce côté.
En conclusion, éviter la 5.x.x pour l'instant en prod (dans mon cas, c'est uniquement pour la tester, donc le localhost ne me gêne pas) et attendre la correction du problème avec une version supérieure (mais laquelle ?).
Aloha