Bonjour,
Moi, perso, je ne touche pas au code de DNN. En cas de MAJ, tu perds tes modifs et, en plus, en cas de bugs, avoir un DNN modifié ne simplifie pas la recherche du souci.
Pour le reste, développe tes modules et, une fois achevé, fais un package d'installation en .zip.
Installe proprement DNN sur ton serveur, et ajoute tes modules.
"Les fois suivantes", mets juste à jour tes modules.
Simon